財團法人國家實驗研究院(簡稱國研院)奉行政院國家科學委員會(簡稱國科會)核准，於2007年1月1日成立「颱風洪水研究中心籌備處」，同年12月7日經國研院董監事聯席會同意通過，本中心之中(英)文名稱為：台灣颱風洪水研究中心(Taiwan
Typhoon and Flood Research Institute)。2008年5月16日國科會召開新設台灣颱風洪水研究中心作業計畫書討論會議，原則同意本中心設立，但應釐清中心之定位、目標、發展方向及工作內容。2009-2010年間，由學者專家與作業單位代表組成之「工作小組」進行多次討論修訂，經國研院初審與諮詢委員會複審後，提報董監事聯席會通過，函送國科會審議。2011年4月19日國科會同意辦理新設台灣颱風洪水研究中心作業計畫書，正式成立「台灣颱風洪水研究中心」(簡稱颱洪中心)，並於同年8月17日舉行揭牌典禮。
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